Красавица Май Токиха и её болезненный младший брат Такуми получают приглашение на учёбу в престижную частную школу Фука, причём администрация школы выделяет им стипендию, что очень существенно для небогатой семьи, утратившей мать ещё в раннем возрасте. Плывя на пароме к месту учёбы, Май участвует в спасении едва не утонувшей странной девушки Макото, извлечённой из воды с огромным чёрным мечом. Однако это чуть не стоило жизни ей самой - на судно с целью убить Макото проникает другая странная девушка Нацуки, и в их завязавшемся поединке, в котором обе используют мощные магические силы, паром начинает разваливаться на части. Пытаясь защитить Макото от Нацуки и её робота-убийцы, Май внезапно открывает в себе HiME-способности - столь сильные, что Нацуки приходится ретироваться.

Так происходит знакомство Май Токиха с двумя другими девушками-HiME, вместе с которыми ей предстоит защитить учеников Фука от Сирот, таинственных монстров, угрожающих школе. Приключения только начинаются!

Эпизоды:
01. This is a Shoujo's Important Event
02. After School Secrets
03. Dance of Flames / Star's Oath
04. Prank of the Wind
05. Rain- -. Tears.....
06. The fiery age of 17
07. The Lost Kittens
08. An Important Thing
09. The sea, the maidens and Natsuki's secret d
10. Cake Wars!!!
11. Rondo of Light and Darkness
12. Angelic Smile
13. Night of the Tamayura
14. Academy at Target
15. High School Girl ?Through the Galaxy
16. Parade d
17. Deceitful, Lips
18. --Beginning
19. Labyrinth in the Heart
20. Dance of Fire / Tearful Destiny
21. You the Dark One, Time to Come Forth
22. Breaking Down......
23. Love and Friendship, Senseless
24. Love is a Battle
25. To the Destined Time
26. Shining days